לעיתים נוצר עובש בדופן הכיסוי ו/או בכריות המופנה אל מי הספא.
היווצרות של עובש נובעת מתחזוקת מים לא מאוזנת (ברום וPH).
במידה ונוצר עובש, ניתן להסירו ע”י אקונומיקה והברשת הכיסוי ו/או הכרית ע”י מברשת קשיחה.
ישנו חומר שנמכר על ידי יעקובי להסרת עובש.
טיפול נכון במי הספא ימנע היווצרות של עובש.